选用以下队伍通关，会看到特别结局：

1、主角队：草薙京、二阶堂红丸、大门五郎(使用草薙京击败大蛇，结局会对决八神庵)

2、三神器队：草薙京、八神庵、神乐千鹤(拳皇97正统结局)

3、师徒队：草薙京、矢吹真吾、第三个人随意，只要不是八神庵或莉安娜就行

4、94女子格斗家队：坂崎百合、不知火舞、King

5、旧时代明星队：拉尔夫、克拉克、麻宫雅典娜

6、SNK超级巨星队：草薙京、特瑞、坂崎亮

7、边缘队：二阶堂红丸、东丈、金家潘

8、Game-ST队：特瑞、东丈、玛丽

9、Fami-Tsu队：陈国汉、蔡宝健、山崎龙二

10、Neo·Geo Freak队：草薙京、不知火舞、比利